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Nature:127個(gè)突變基因致12種癌癥類型

2013-10-19 11:02 閱讀:2946 來源:生物谷 作者:網(wǎng)* 責(zé)任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們通過檢測(cè)12種主要的癌癥類型,鑒別出了127個(gè)似乎驅(qū)動(dòng)了機(jī)體眾多腫瘤發(fā)生與發(fā)展的多次突變基因。這一研究發(fā)現(xiàn)為設(shè)計(jì)出新的診斷工具及更個(gè)體化的癌癥治療創(chuàng)造了條件。相關(guān)論文發(fā)表在著名科學(xué)期刊《自然》(Nature)雜志上。

    作為“癌癥基因組圖譜”之Pan-Cancer項(xiàng)目的一部分,本文作者發(fā)表了對(duì)來自超過3000個(gè)腫瘤、代表12個(gè)腫瘤類型的點(diǎn)突變和小“得失位”所做的數(shù)據(jù)分析。他們的發(fā)現(xiàn)包括127個(gè)顯著突變的基因,它們來自與癌癥有已經(jīng)確定的聯(lián)系和新發(fā)現(xiàn)聯(lián)系的細(xì)胞過程。他們還發(fā)現(xiàn),腫瘤形成所需的驅(qū)動(dòng)突變的數(shù)量是相對(duì)較小的。進(jìn)一步的分析還識(shí)別出了對(duì)存活有顯著影響的基因以及腫瘤發(fā)生過程中的突變事件的可能時(shí)間順序。

    來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們通過檢測(cè)12種主要的癌癥類型,鑒別出了127個(gè)似乎驅(qū)動(dòng)了機(jī)體眾多腫瘤發(fā)生與發(fā)展的多次突變基因。這一研究發(fā)現(xiàn)為設(shè)計(jì)出新的診斷工具及更個(gè)體化的癌癥治療創(chuàng)造了條件。相關(guān)論文發(fā)表在著名科學(xué)期刊《自然》(Nature)雜志上。

    論文的資深作者是華盛頓大學(xué)基因研究所的丁莉(Li Ding)博士,其早年畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué),是世界著名的基因科學(xué)家。近期湯森?路透(Thomson Reuter)旗下的ScienceWatch網(wǎng)站,通過分析論文的引用次數(shù),篩選出了2012年度“最熱門的科學(xué)家“,全球有21位科學(xué)家入選,丁莉博士榜上有名。 新研究表明通常在某些癌癥中發(fā)生突變的一些基因,也存在于看似無關(guān)的腫瘤中。例如,一種在25%的白血病病例中發(fā)生突變的基因,也被發(fā)現(xiàn)存在于乳腺癌、直腸癌、頭頸部癌、腎癌、肺癌、卵巢癌和子宮癌中。

    基于這些研究結(jié)果,研究人員設(shè)想采用一種測(cè)試來檢測(cè)一組癌基因中的錯(cuò)誤,最終有可能成為大多數(shù)癌癥標(biāo)準(zhǔn)診斷檢查的一個(gè)組成部分。這樣的檢測(cè)結(jié)果有可能會(huì)基于患者獨(dú)特的遺傳特征來指導(dǎo)治療決策。

    由于基因組測(cè)序的發(fā)展,科學(xué)家們能夠以比數(shù)年前更快的速度,更便宜的價(jià)格對(duì)癌細(xì)胞DNA展開分析,因而使得生成一些關(guān)于癌癥的新見解成為可能。盡管早期的基因組研究通常側(cè)重于個(gè)別腫瘤類型,當(dāng)前的研究則是率先聚焦多種不同癌癥類型的研究之一。

    丁莉博士說:“這僅僅是一個(gè)開始。許多的腫瘤科醫(yī)生和科學(xué)家們都想知道,是否有可能能夠提出一個(gè)導(dǎo)致所有人類癌癥的癌基因完整清單。我認(rèn)為我們正越來越接近它。”

    新研究分析了來自3,281個(gè)腫瘤的基因——這些腫瘤匯集了乳腺癌、子宮癌、頭頸部癌、結(jié)直腸癌、膀胱癌、腎癌、卵巢癌、肺癌、腦癌和血癌。除發(fā)現(xiàn)了不同癌癥中基因之間的一些共同聯(lián)系,研究人員還鑒別出了一些特定癌癥類型獨(dú)有的突變。

    檢測(cè)跨越許多不同癌癥類型的大量腫瘤,為研究人員提供了必要的統(tǒng)計(jì)效力來鑒別顯著突變基因。這些頻繁發(fā)生于某些癌癥,而在另一些癌癥中很少存在的遺傳錯(cuò)誤,被認(rèn)為對(duì)于癌癥生長(zhǎng)極其重要。

    盡管腫瘤中突變基因的平均數(shù)量隨癌癥類型各異,大多數(shù)的腫瘤都只有2-6個(gè)驅(qū)動(dòng)癌癥的基因突變。研究人員說,這或許就是為何癌癥如此常見的一個(gè)原因。“盡管體內(nèi)的細(xì)胞多年來不斷地累積新突變,將一個(gè)健康細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)榘┘?xì)胞則只需要重要驅(qū)動(dòng)基因的少數(shù)幾個(gè)突變,”丁莉說。

    包括共同第一作者、華盛頓大學(xué)的Cyriac Kandoth博士和Michael McLellan,以及合作者、布朗大學(xué)的Benjamin Raphael博士在內(nèi)的科學(xué)家們,鑒別出了對(duì)于生存具有重要影響的基因。

    TP53,一種眾所周知的癌相關(guān)基因,其在不同的癌癥類型中最為常見。它被發(fā)現(xiàn)存在于42%的樣本,尤其是在腎癌、頭頸部癌和急性髓細(xì)胞性白血病中,與不良預(yù)后相關(guān)。

    另一個(gè)基因BAP1也與不良預(yù)后有關(guān),特別是在腎癌和子宮癌患者中。

    而乳腺癌基因BRCA2突變則與卵巢癌生存率增高相關(guān),IDH1錯(cuò)誤與一種尤其具侵襲性的腦瘤——成膠質(zhì)細(xì)胞瘤及其他的癌癥類型預(yù)后改善相關(guān)。

    華盛頓大學(xué)基因組研究所目前正在開展一項(xiàng)尋找其他癌基因的研究。制定出一張更全面的癌基因列表有可能為改善癌癥診斷,指導(dǎo)治療決策提供支持。

    “由于我們現(xiàn)在知道,例如在白血病中突變的基因也可以在乳腺癌中發(fā)生改變,肺癌中的遺傳錯(cuò)誤也可以出現(xiàn)在結(jié)直腸癌中,我們認(rèn)為開發(fā)出一種納入所有的癌基因的診斷測(cè)試將是完美的。這將能夠?yàn)槲覀兲峁└鼮橥暾哪[瘤發(fā)生事件圖像,并且可以利用這些信息來制定治療決策,”丁莉說。


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