來自加州大學(xué)洛杉磯醫(yī)學(xué)院、新加坡**大學(xué)和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)的研究人員,采用全外顯子組測(cè)序和目標(biāo)區(qū)域深度測(cè)序技術(shù)鑒別出了食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)的一些新基因組及分子特征。這一重要的研究成果發(fā)表在3月30日的《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的王明榮(Ming-Rong Wang)研究員和加州大學(xué)洛杉磯醫(yī)學(xué)院的林德晨(De-Chen Lin,音譯)博士是這篇論文的共同通訊作者。王榮明研究員長(zhǎng)期從事腫瘤遺傳學(xué)和腫瘤分子生物學(xué)工作,研究方向?yàn)榘┳兎肿訖C(jī)理及腫瘤分子標(biāo)志,包括腫瘤細(xì)胞及分子遺傳學(xué)、腫瘤早期診斷及預(yù)警的分子標(biāo)志、癌前病變與轉(zhuǎn)歸的分子機(jī)理、腫瘤侵襲性生長(zhǎng)及轉(zhuǎn)移的分子機(jī)理、腫瘤蛋白質(zhì)表達(dá)譜等。
ESCC是世界上最常見的惡性疾病之一,且大部分的病例發(fā)生在中國(guó),是中國(guó)第四位的癌癥相關(guān)死亡原因。不同于乳腺癌、結(jié)腸癌等這些得到廣泛研究的癌癥類型,近幾十年來食管鱗狀細(xì)胞癌的臨床診斷及治療方法有限,患者的5年生存率為15-25%。
以往的研究已經(jīng)揭示出了一些與3q26、9p21、11q13.3和8q24.3區(qū)域相關(guān)的ESCC頻發(fā)體細(xì)胞拷貝數(shù)變異(SCNV),以及PIK3CA7、TP53和NOTCH1等基因體細(xì)胞突變。然而這些研究對(duì)于ESCC基因組變異的了解往往僅限于小群的患者。因此,迫切需要更廣泛地鑒別ESCC的潛在基因組變異,闡明其分子基礎(chǔ),引導(dǎo)開發(fā)出有的
靶向治療方法
在這篇新文章中,作者們報(bào)告稱對(duì)139對(duì)ESCC生殖細(xì)胞系和腫瘤進(jìn)行了全外顯子組測(cè)試或目標(biāo)區(qū)域深度測(cè)序,并對(duì)180多個(gè)ESCCs進(jìn)行了體細(xì)胞拷貝數(shù)變異(SCNV)分析。除了已知的TP53、PIK3CA和NOTCH1,他們還鑒別出了一些新的突變基因,如FAT1、FAT2、ZNF750和KMT2D。進(jìn)一步的SCNV評(píng)估、免疫組織化學(xué),結(jié)果表明了這些新基因與ESCC的功能相關(guān)性。
值得注意的是,研究人員發(fā)現(xiàn)在這一癌癥類型中多種分子機(jī)制常常導(dǎo)致了RTK-MAPK-PI3K信號(hào)通路、細(xì)胞周期和表觀遺傳調(diào)控出現(xiàn)異常。他們還揭示出了大量的藥物可及的候選靶點(diǎn),并鑒于XPO1存在基因突變以及蛋白質(zhì)過表達(dá)現(xiàn)象,研究人員將其視作治療靶點(diǎn)開展了更進(jìn)一步的研究。
新研究揭示出了ESCC中一些新的遺傳損傷,這為了解食管腫瘤的發(fā)病機(jī)制以及開發(fā)出新的治療靶點(diǎn)提供了重要的分子基礎(chǔ)。