由深圳華大基因研究院、深圳市第二人民醫(yī)院（簡稱市二院）等單位組成的科研團隊，通過對99個膀胱癌患者樣本進行全基因組及全外顯子測序研究，發(fā)現(xiàn)了與姐妹染色單體結(jié)合及分離（sister chromatid cohesion and segregation, SCCS）相關(guān)的基因突變，為膀胱癌診斷、治療提供了新思路。最新研究成果于2013年10月13日在《自然。遺傳學(xué)》（Nature Genetics）雜志上發(fā)表。

    膀胱癌發(fā)病率居泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤的首位，而在西方國家其發(fā)病率僅次于前列腺癌，居第2位。膀胱移行細胞癌（TCC）是膀胱癌中最常見的組織學(xué)類型，男性發(fā)病率約為女性的3——4倍，多發(fā)生于40-70歲之間。目前，中國男性膀胱癌的年發(fā)病率已達十萬分之八，并呈逐年上升的趨勢。對于這一重要癌癥，目前卻沒有充足的基因組學(xué)數(shù)據(jù)供科研人員開發(fā)新的治療方法以攻克膀胱癌。

    來自華大基因和市二院的科研人員對99個膀胱癌患者的組織樣本進行了全基因組測序和全外顯子測序，共發(fā)現(xiàn)13個重要的新突變基因和24個已知突變基因如TP53,HRAS, FGFR3,PIK3CA以及KRAS等。在所發(fā)現(xiàn)的新突變基因中，位于X染色體上的STAG2基因顯得尤為特別，該基因與SCCS過程息息相關(guān)?？蒲腥藛T發(fā)現(xiàn)STAG2基因發(fā)生了高頻非同義突變，并且11個發(fā)生該基因突變的樣品中有9個都是終止突變。此外，與SCCS相關(guān)的ESPL1基因也發(fā)生了高頻突變。

    研究人員還通過轉(zhuǎn)錄組測序?qū)?2對組織樣品進行了研究，結(jié)果發(fā)現(xiàn)有32個潛在的基因重排可能會導(dǎo)致基因融合，并證實FGFR3和TACC3基因發(fā)生了融合。研究還發(fā)現(xiàn)，TACC3的高表達不是TACC3基因自身的擴增導(dǎo)致的，而是通過FGFR3這個轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子來調(diào)節(jié)的。

    此外，研究結(jié)果顯示染色體的非整倍體性及不穩(wěn)定性與膀胱癌發(fā)生有關(guān)，并使膀胱癌成為首個擁有SCCS相關(guān)基因突變的癌癥。此外，本研究為膀胱移行細胞瘤提供了更全面綜合的基因組突變信息，并證明基因突變可影響SCCS過程，同時為膀胱癌的診斷治療提供了一種新的可能性。

    華大基應(yīng)該項目負責人陳超指出：“在這次研究中，我們發(fā)現(xiàn)了多個與SCCS相關(guān)的突變，包括STAG2、ESPL1基因的高頻突變以及FGFR3-TACC3基因融合。這一發(fā)現(xiàn)證實SCCS相關(guān)基因突變確實與膀胱癌的發(fā)生有關(guān)，極大地推動了膀胱癌遺傳學(xué)研究，同時也為膀胱癌的診斷治療提供了新思路。此外，研究中所獲得的數(shù)據(jù)資源也為以后膀胱癌的深入研究奠定了重要的科研基礎(chǔ)。”