十年前，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)還是一個(gè)方興未艾的全新概念，到今天，隨著技術(shù)的日新月異，它已經(jīng)成為令人矚目的研究焦點(diǎn)，其不斷實(shí)現(xiàn)的成果，為臨床領(lǐng)域的實(shí)踐提供了有效、便捷、廉價(jià)的服務(wù)手段和模式。5月16日，在杭州舉辦的“2014轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)高峰論壇”上，賽默飛世爾科技公司旗下Life Technologies中國(guó)區(qū)儀器平臺(tái)消瘦總監(jiān)張焱女士指出，基因組工具的發(fā)展突飛猛進(jìn)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)正從一個(gè)平臺(tái)深入到醫(yī)療領(lǐng)域的方方面面，創(chuàng)新技術(shù)和方法令人應(yīng)接不暇，臨床應(yīng)用迎來(lái)了前所未有的機(jī)遇期。為了能更好地順應(yīng)這一趨勢(shì)，無(wú)論是儀器設(shè)備的制造商和消瘦商還是研究人員，都需要和終端使用者密切聯(lián)系，共同開發(fā)出適應(yīng)市場(chǎng)需求的產(chǎn)品。

    基因轉(zhuǎn)化醫(yī)療服務(wù)成果顯著

    1992年，美國(guó)《科學(xué)》雜志首次提出了基因檢測(cè)從實(shí)驗(yàn)室到病床的概念，2003年，美國(guó)**衛(wèi)生研究院（NIH）院長(zhǎng)Zerhouni在《自然》雜志上為轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)發(fā)展畫出路線圖，希望填補(bǔ)基礎(chǔ)研究與臨床應(yīng)用之間的鴻溝。其“從實(shí)驗(yàn)臺(tái)到病床”的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)理念，旨在將實(shí)驗(yàn)室的科研成果轉(zhuǎn)化為有價(jià)值的臨床應(yīng)用。

    基因檢測(cè)就是典型的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)應(yīng)用。本世紀(jì)初，人類基因組草圖繪制的完成標(biāo)志著第一代基因測(cè)序技術(shù)的成熟，對(duì)一個(gè)或幾個(gè)基因的測(cè)序開始應(yīng)用在臨床上，對(duì)基因突變測(cè)量的分辨率得以提升，在傳染病的鑒定以及癌癥等致命性疾病的靶向治療中應(yīng)用廣泛。2013年5月，著名女星安吉麗娜·茱莉在《**》上發(fā)表了《我的醫(yī)療選擇》一文，宣布通過(guò)基因檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)自己攜帶了“錯(cuò)誤的基因”BRCA1，確定她罹患乳腺癌的幾率為87%，她選擇采取預(yù)防性雙側(cè)乳腺切除手術(shù)，希望將這一風(fēng)險(xiǎn)降至5%，這一舉動(dòng)將基因測(cè)序轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的成果帶入全球公眾的視線，成為“從實(shí)驗(yàn)臺(tái)到病床”的一次經(jīng)典嘗試，也為基因檢測(cè)技術(shù)市場(chǎng)帶來(lái)新的契機(jī)。

    通過(guò)對(duì)基因篩查和檢測(cè)，可盡早發(fā)現(xiàn)遺傳病因，進(jìn)行腫瘤風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)與個(gè)體化治療，依據(jù)藥物基因組學(xué)采用個(gè)體化用藥，對(duì)傳染病病原微生物和病毒的鑒定等，幫助醫(yī)生診斷疾病的型別，同時(shí)指導(dǎo)醫(yī)生對(duì)患者個(gè)體提出合理的解決方案，使得診療更安全、更快速和更有效。

    一代測(cè)序和新一代測(cè)序技術(shù)各有千秋

    目前，基因檢測(cè)的市場(chǎng)依賴于技術(shù)發(fā)展獲得推廣。一代測(cè)序在臨床上經(jīng)過(guò)了十多年的發(fā)展，逐漸建立了完整的體系，并不斷地將成本降低，漸漸的成為老百姓討論的話題，也反過(guò)來(lái)促進(jìn)了測(cè)序市場(chǎng)的發(fā)展。第一代檢測(cè)技術(shù)是對(duì)一個(gè)***基因片段做檢測(cè)，1986年發(fā)展至今已27年，技術(shù)上成熟、簡(jiǎn)單、可靠；而新一代高通量測(cè)序可以對(duì)多個(gè)基因片斷進(jìn)行檢測(cè)并對(duì)單分子基因做大規(guī)模平行測(cè)序。

    實(shí)踐表明，以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間，使用了新一代測(cè)序技術(shù)僅僅需要1周，在序列讀長(zhǎng)方面比起第一代測(cè)序技術(shù)則要短很多。瑞士Viollier AG 實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人Kurth博士舉例說(shuō)，對(duì)非小細(xì)胞肺癌中的ALK（間變性淋巴激酶）基因進(jìn)行測(cè)序，以前用PCR（多重鏈?zhǔn)椒磻?yīng)聚合技術(shù)）抓取，時(shí)間大約1—3周，而使用了出自Life Technologies公司的Ion Ampliseq，即基于高通量新一代基因測(cè)序設(shè)備，調(diào)動(dòng)目的基因或靶向基因的方法，使得基因檢測(cè)的時(shí)間只需1—2小時(shí)。

    從應(yīng)用角度上講，一代和新一代測(cè)序設(shè)備在功能上是并存關(guān)系，而非完全的替代關(guān)系。

    廣東省人民醫(yī)院廣東省肺癌研究所副所長(zhǎng)、中心實(shí)驗(yàn)室主任張緒超研究員認(rèn)為，作為分子檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn)，一代測(cè)序已經(jīng)成為個(gè)性化治療廣闊市場(chǎng)的主角，而新一代測(cè)序則是未來(lái)基因檢測(cè)市場(chǎng)的應(yīng)用方向；其升級(jí)版本主要在實(shí)驗(yàn)室和臨床試用階段，還沒有獲得廣泛的臨床應(yīng)用。

    測(cè)序技術(shù)與臨床結(jié)合應(yīng)用廣泛

    參加此次杭州轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)論壇的澳大利亞西澳大學(xué)的Richard Allcock教授一直做致病基因的篩查研究，從事過(guò)產(chǎn)前篩查、脊椎病等基因檢測(cè)。在對(duì)神經(jīng)肌肉疾病的基因測(cè)序中，他在Ion Torrent 測(cè)序平臺(tái)上，從336個(gè)相關(guān)基因中找尋69個(gè)相關(guān)基因，并從中發(fā)現(xiàn)了一種致病基因。Richard Allcock教授表示，首先，利用新一代技術(shù)要比一代技術(shù)節(jié)省時(shí)間，無(wú)須單個(gè)基因一隔一個(gè)比對(duì)，其次，疾病基因的找尋和檢驗(yàn)應(yīng)該與臨床治療全面結(jié)合，一旦找到對(duì)應(yīng)致病基因的位點(diǎn)后，研究人員應(yīng)與臨床醫(yī)生相互合作，將臨床治療結(jié)果隨時(shí)反饋給研究平臺(tái)。由雙方共同提出臨床方案，應(yīng)該是未來(lái)基因測(cè)序應(yīng)用的一種最佳模式。

    藥明康德公司孫樂***士指出，美國(guó)在CLIA（臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案標(biāo)準(zhǔn)）認(rèn)證實(shí)驗(yàn)室中，采用Ion Torrent系列平臺(tái)及 AmpliSeq定制Panel進(jìn)行腫瘤基因檢測(cè)服務(wù)，比如波士頓兒童醫(yī)院有產(chǎn)前遺傳病篩查的項(xiàng)目，M.D. Anderson癌癥中心、美國(guó)梅奧診所等醫(yī)學(xué)中心開展乳腺癌、直腸癌等癌癥相關(guān)的熱點(diǎn)基因檢測(cè)。

    數(shù)字PCR技術(shù)有待推廣

    數(shù)字PCR（Digital PCR-dPCR）技術(shù)是一種新的核酸（DNA/RNA）檢測(cè)和定量方法，與傳統(tǒng)定量PCR（qPCR）技術(shù)不同，其采用絕對(duì)定量的方式，不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線和參照樣本，直接檢測(cè)目標(biāo)序列的拷貝數(shù)。由于這種檢測(cè)方式具有比傳統(tǒng)qPCR更加出色的靈敏度和特異性、精確性，dPCR迅速得到廣泛的應(yīng)用。

    據(jù)介紹，這項(xiàng)技術(shù)在極微量核酸樣本檢測(cè)、復(fù)雜背景下稀有突變檢測(cè)和表達(dá)量微小差異鑒定方面表現(xiàn)出的優(yōu)勢(shì)已被普遍認(rèn)可，而其在基因表達(dá)研究、microRNA研究、基因組拷貝數(shù)鑒定、癌癥標(biāo)志物稀有突變檢測(cè)、致病微生物鑒定、轉(zhuǎn)基因成分鑒定、NGS測(cè)序文庫(kù)精確定量和結(jié)果驗(yàn)證等諸多方面具有的廣闊應(yīng)用前景受到越來(lái)越多的關(guān)注，但是，在應(yīng)用層面還有待推廣。

    “測(cè)序技術(shù)不斷推陳出新，我們期待著能在臨床實(shí)踐中有更多的應(yīng)用，”張焱說(shuō)，“研究機(jī)構(gòu)和臨床醫(yī)生的合作和信任是轉(zhuǎn)換醫(yī)學(xué)的關(guān)鍵，我們將樂于為此模式而努力。”