最近，美國福賽思研究所、麻省綜合醫(yī)院（MGH）和哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院等處的科學(xué)家，開發(fā)出一種新的方法，收集用于基因組和轉(zhuǎn)錄組分析的唾液與糞便。該方法不需要專業(yè)人員和設(shè)施，同時(shí)還能保持樣品的完整性。這種方法也為消化道微生物組的基因組成和乳糜瀉、口腔癌、牙周炎和肥胖癥相關(guān)的細(xì)菌，提供了重要的見解。

    這項(xiàng)研究以“Relating the metatransc**tome and metagenome of the human gut”為題，在線發(fā)表于2014年5月19日的《PNAS》雜志。這種技術(shù)可減輕受試對(duì)象的一些負(fù)擔(dān)，將使我們能夠不受地理限制，開展縱向研究和大規(guī)模的收集研究。

    2007年，美國**健康研究所（NIH）出資1.5億美元啟動(dòng)了一項(xiàng)名為“人類微生物組項(xiàng)目”（Human Microbiome Project）的研究計(jì)劃，對(duì)人體內(nèi)最常見的細(xì)菌基因組進(jìn)行測(cè)序，以便更好地研究細(xì)菌與人體健康的關(guān)系。近年來，該計(jì)劃已經(jīng)幫助確定了人體的正常細(xì)菌組成?？茖W(xué)家們已經(jīng)進(jìn)行了大規(guī)模的研究來分析生活在人體內(nèi)外的微生物（細(xì)菌）。研究人類與細(xì)菌之間的相互作用，可以帶來監(jiān)測(cè)人體健康狀況、預(yù)防或治療口腔和全身性疾病的新方法。然而，這些研究通常需要受試者到門診進(jìn)行樣品采集，這種復(fù)雜的做法對(duì)大型研究是不切實(shí)際的。

    雖然科學(xué)家們已經(jīng)很好地研究了人類微生物組的成分，但是微生物群里約有超過800萬個(gè)基因還是未知的，并且它們的調(diào)控機(jī)制很大程度上沒有得以描述。這方面的知識(shí)空白，部分原因也是由于很難獲取大量適合微生物群功能研究的樣品。

    為了解決這些問題，這個(gè)科學(xué)家小組開發(fā)出一種方法，可讓受試者在家里收集微生物樣品，然后將其運(yùn)至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行多種類型的分子分析。盡管采用不同的取樣方法，微生物種類、基因和基因轉(zhuǎn)錄組成，在所有樣品中都是一致的。隨后對(duì)這些樣品進(jìn)行的分析顯示，測(cè)量的人類微生物組的功能潛力和功能活性之間存在著有趣的異同點(diǎn)。

    在這項(xiàng)研究中，研究人員在一個(gè)表型良好的前瞻性隊(duì)列中，利用受試者自己收集的人體多部位樣品，結(jié)合表型分類學(xué)、宏基因組學(xué)和宏轉(zhuǎn)錄組（metatransc**tional）譜，進(jìn)行了第一個(gè)人類微生物組研究。結(jié)果詳細(xì)描述了腸道菌群基因組潛能和基因表達(dá)之間的關(guān)系，論證了在受試者收集和運(yùn)輸?shù)臉悠分虚_展宏轉(zhuǎn)錄組研究的可行性。

    福賽思研究所的工作人員Jacques Izard博士、哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院的Curtis Huttenhower博士和麻省綜合醫(yī)院的Andrew Chan博士共同合作，設(shè)計(jì)了固定劑的選擇和取樣流程。

    Izard博士說：“我們感到興奮的是，這種方法提供了將來進(jìn)行大規(guī)模研究的機(jī)會(huì)。隨著測(cè)序技術(shù)的靈敏度和計(jì)算工具的改進(jìn)，我們可以檢測(cè)到很細(xì)微的變化。我們的合作小組證明，我們可以分析受試者自己收集和運(yùn)輸?shù)臉悠?，為將來生物?biāo)志物的發(fā)現(xiàn)建立了自信。”

    Chan博士指出：“多項(xiàng)縱向的哈佛隊(duì)列研究——包括護(hù)士健康研究和健康專業(yè)人士隨訪研究，追隨了居住在美國的超過200,000個(gè)人。在過去的30年中，參與者為我們提供了關(guān)于飲食、生活方式和多種疾病診斷方面的大量前瞻性信息。在這項(xiàng)工作中，我們論證了這些參與者自己在家中收集樣品的可行性。如果能將這種收集法應(yīng)用于更大隊(duì)列中，那對(duì)于將微生物組作為多種慢性疾病危險(xiǎn)因素的研究來說，將是一個(gè)很好的機(jī)會(huì)。”