FLJ和rFLJ中contigs與序列數(shù)據(jù)庫中所有非冗余的(non-redundant)數(shù)據(jù)BlastX分析結果
近日,中國科學院北京基因組研究所重點實驗室于軍研究員及其團隊同中國中醫(yī)科學院中藥研究所開展合作,利用新一代高通量測序平臺(Illumina's GA平臺)分別對兩種不同藥效金銀花品種(FLJ和rFLJ)的三個不同階段的基因表達進行了測序分析,相關研究成果在《BMC Genomics》雜志發(fā)表。
金銀花屬忍冬科,它作為抗炎免疫的中藥材有著悠久的歷史,并且具有宣散風熱,清解血毒等功效。但金銀花的化學質量較不穩(wěn)定,不利于對其進行質量評估。此次科研人員通過對其開展基因組相關分析,不僅得到金銀花不同花期的轉錄表達圖譜,同時還建立了相關的酶庫。研究中,科研人員整合轉錄組與代謝途徑分析,揭示這一體系是否用于評價金銀花的活性成分積累及其品質。并根據(jù)進化分析揭示了金銀花直系同源和旁系同源特定功能分化以及控制活性成分的基因功能差異。以上工作的開展,為評估金銀花質量金銀花中草藥的研究及其藥效評估奠定了重要的科學基礎。
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