您所在的位置:首頁 > 腫瘤科醫(yī)學(xué)進展 > Nature子刊:測序循環(huán)腫瘤細(xì)胞的外顯子組
科學(xué)家們首次對循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)進行了單細(xì)胞外顯子組測序,這樣的技術(shù)可以為人們展示腫瘤演化、轉(zhuǎn)移和應(yīng)答藥物的具體過程。
前列腺腫瘤很容易轉(zhuǎn)移到骨組織,而這樣的轉(zhuǎn)移很難用傳統(tǒng)方法進行檢測。這個問題大大影響了醫(yī)生們對癌癥的監(jiān)控和治療?,F(xiàn)在一項新研究指出,只需要簡單抽血就可以解決這個問題,監(jiān)控腫瘤的演化和轉(zhuǎn)移。
Broad研究所的科學(xué)家們在Nature Biotechnology雜志上發(fā)表文章,描述了一個模塊化的新技術(shù)平臺。該平臺可以收集前列腺癌患者血液中的循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC),并對其進行外顯子組測序和分析。這一技術(shù)可以揭示高度可信的單核苷酸突變,幫助人們追蹤腫瘤的演化、引導(dǎo)對腫瘤的治療、監(jiān)控腫瘤的復(fù)發(fā),
上述一平臺由幾個部分組成,首先研究人員使用Illumina的MagSweeper技術(shù),從患者血液中富集EpCAM陽性的細(xì)胞,EpCAM是促進腫瘤形成的蛋白。然后,研究人員通過自己開發(fā)的方法,將這些細(xì)胞一一分配到小孔中,并通過成像技術(shù)檢測特定標(biāo)記的表達。最后他們收集符合要求的細(xì)胞,進行細(xì)胞裂解,全基因組擴增和文庫制備。
研究人員先對文庫進行低覆蓋度測序,以評估基因組的質(zhì)量。然后他們再對符合要求的進行高覆蓋度的外顯子組測序。由于之前還沒有完成過單個CTC的外顯子組測序,研究團隊采用了“census”方案來檢出序列突變。如果在同一個體的三個CTC文庫中都出現(xiàn)了特定突變,這一突變就被認(rèn)為是真實可信的。
“將許多細(xì)胞結(jié)合起來,就可以獲得精確的目標(biāo)序列(超過99.995%),”Boehm說。
研究團隊通過上述方案,研究了患者CTC與原發(fā)瘤和轉(zhuǎn)移瘤之間的關(guān)聯(lián)。研究顯示,在CTC中鑒定到的73個變異中,有51個也出現(xiàn)在原發(fā)瘤或轉(zhuǎn)移瘤。
這樣的數(shù)據(jù)可以為人們展示腫瘤的演化、CTC的來源、以及藥物治療的效果,Love說。通過驗血監(jiān)控CTC基因組,可以揭示抗性指標(biāo)的出現(xiàn),以及腫瘤復(fù)發(fā)的風(fēng)險。人們也可能在監(jiān)控時發(fā)現(xiàn)可以用藥物控制的突變,為醫(yī)生們提供新的治療途徑。
據(jù)Boehm介紹,這種平臺的模塊化設(shè)計意味著,理論上只需要簡單改變某個模塊就可以將其應(yīng)用于任何類型的腫瘤。舉例來說,可以根據(jù)不同的指標(biāo)修改富集策略。“模塊化和靈活性使這一平臺有著廣闊的應(yīng)用前景。”
麻省總醫(yī)院的Daniel Haber強調(diào),通過血樣對治療效果、腫瘤復(fù)發(fā)和抗性進行監(jiān)控,能夠為多種癌癥的提供幫助。此外“將這項研究中的技術(shù)應(yīng)用到EpCAM陰性CTC,將是很有意思的嘗試”他說。
肺癌已成為我國惡性腫瘤發(fā)病率和死亡率之首,分別占比19.59%和24.87...[詳細(xì)]
在我國,肺癌發(fā)病率位居惡性腫瘤首位,約為46.08/10萬,占所有惡性腫瘤...[詳細(xì)]
意見反饋 關(guān)于我們 隱私保護 版權(quán)聲明 友情鏈接 聯(lián)系我們
Copyright 2002-2024 Iiyi.Com All Rights Reserved